Новый коронавирус, как и все другие вирусы, мутирует или претерпевает небольшие изменения в своем геноме. Недавно опубликованное исследование показало, что новый коронавирус, SARS-CoV-2, уже мутировал в еще один и менее агрессивный штамм. Но эксперты не уверены.
Исследователи обнаружили тип «L», который они считали более агрессивным, в 70% образцов вируса. Они также обнаружили, что распространенность этого штамма снизилась после начала января. Более распространенный тип сегодня - это более старый тип «S», потому что «вмешательство человека», такое как карантин, могло снизить способность распространения типа «L», пишут исследователи в статье.
Последние новости о коронавирусе
-Живые обновления на коронавирус
-Каковы симптомы?
-Насколько смертелен новый коронавирус?
-Как это соотносится с сезонным гриппом?
-Как распространяется коронавирус?
-Могут ли люди распространять коронавирус после выздоровления??
Тем не менее, Натан Грэбо, эпидемиолог из Йельской школы общественного здравоохранения, который не принимал участия в исследовании, сказал, что выводы авторов являются «чистой спекуляцией». Во-первых, по его словам, мутации, на которые ссылались авторы исследования, были невероятно малы - порядка пары нуклеотидов, основных строительных блоков генов, сказал он. (SARS-CoV-2 имеет длину около 30000 нуклеотидов).
Эти небольшие изменения, скорее всего, не окажут существенного влияния на функционирование вируса, если оно вообще будет иметь место, поэтому было бы «неверно» говорить, что эти различия означают, что существуют разные штаммы, сказал он. Кроме того, исследователи рассмотрели только 103 случая. «Это очень небольшая выборка из всей популяции вирусов», - сказал Грубо. По его словам, выяснение мутаций, которым подвергся вирус во всем мире, требует «нетривиальных усилий, а иногда и года».
Другие ученые согласны. Обнаружение того, что коронавирус мутирует в два штамма со штаммом L, приводящим к более тяжелому заболеванию, является, скорее всего, статистическим артефактом », - написал в Twitter Ричард Нехер, биолог и физик из Базельского университета в Швейцарии. Этот статистический эффект, вероятно, связан с ранней выборкой группы L в Ухани, что привело к «более высокой очевидной» смертности от случаев, пишет он.
Когда быстро растет локальная вспышка, ученые быстро отбирают у пациентов геномы вируса, что приводит к чрезмерной представленности некоторых вариантов вируса, пишет Нехер. Авторы статьи признают, что данные в их исследовании «все еще очень ограничены», и им необходимо использовать более крупные наборы данных, чтобы лучше понять, как развивается вирус, пишут они.
«Мы не должны беспокоиться»
Зная, что такие документы появятся во время этой вспышки, 18 февраля Грубо опубликовал комментарий в журнале Nature Microbiology под заголовком «Мы не должны беспокоиться, когда вирус мутирует во время вспышек болезни».
Мутация слова «естественно вызывает в воображении страх перед неожиданными и странными изменениями», написал он. «На самом деле мутации являются естественной частью жизненного цикла вируса и редко оказывают серьезное влияние на вспышки». РНК-вирусы или те, которые имеют РНК в качестве основного генетического материала вместо ДНК, включая SARS-CoV-2, постоянно мутируют и не имеют механизмов для исправления этих «ошибок», как, например, клетки человека.
Но большинство этих мутаций негативно влияют на вирус. Если мутации не являются полезными для вируса, они, как правило, устраняются посредством естественного отбора, механизма эволюции, благодаря которому организмы, лучше приспособленные к окружающей среде, как правило, выживают. Другие мутации выживают и встраиваются в «средний» геном вируса.
Как пишет Грубо, как правило, множественные гены кодируют такие признаки, как серьезность вируса или способность передавать другим людям. Таким образом, чтобы вирус стал более тяжелым или передавал легче, несколько генов должны были мутировать. Несмотря на высокий уровень мутаций среди вирусов в целом, необычно находить вирусы, которые изменяют свой способ передачи между людьми в столь короткие сроки, пишет он.
Итак, что все это значит для разработки возможной вакцины?
Эти вирусы «все еще настолько генетически сходны, что эти мутации не должны изменять новую вакцину», - сказал Грэбо. «Маловероятно, что разработчики должны беспокоиться об этом». Однако, как только вакцина выйдет, вирус может адаптироваться к ней и развить резистентность, сказал он, но, учитывая, что другие РНК-вирусы, такие как те, которые вызывают корь, эпидемический паротит и желтую лихорадку, не развивают резистентность к вакцинам, этот сценарий вряд ли.
Фактически, эти мутации помогают ученым отследить шаги вируса, сказал Грэбо.
Например, группа исследователей в Бразилии недавно изолировала SARS-CoV-2 от двух пациентов, у которых было подтверждено наличие COVID-19, и секвенировали полные геномы обоих образцов вируса. Они обнаружили, что геномы не только отличались друг от друга, но они также сильно отличались от геномов образцов вирусов, секвенированных в Ухане, Китай, исследователи написали в отчете, который не был рецензирован, но опубликован на форуме. 28 февраля.
У коронавируса, взятого у одного пациента в Бразилии, был геном, аналогичный геному вируса, секвенированного в Германии, а вирус у второго пациента был похож на ген коронавируса в Соединенном Королевстве. Это означает, что эти два пациента связаны с случаями в Европе, но не друг с другом, сказал Грубо.
